1911年11月15日，福建军政府厦门军政分府成立，随即恢复兴泉永道，仍为省级政府的派出机构，在行政区划上，厦门岛仍属同安县嘉禾里。1912年，撤销兴泉永道，以其辖区设南路道（1914年改为厦门道），道台衙署设在厦门。同年4月，厦门岛、金门岛及附近的岛屿（不包括鼓浪屿）从同安县划出成立思明县。1915年1月，大、小金门岛和大、小嶝岛从思明县析出，设立金门县。1933年11月，国民革命军第十九路军发动“闽变”，成立“中华共和国人民革命政府”，升思明县为厦门市，旋改厦门特别市。翌年1月，“闽变”失败，厦门特别市随之撤销，恢复思明县建制。1935年4月1日，厦门市成立，为福建省直辖市，市区范围即将军祠以西、厦门大学以北、湖滨南路以南约10平方千米范围；禾山设特别区，直属省政府及第四行政督察区管辖。1937年9月，禾山特别区改为甲种区，划归厦门市管辖，厦门市辖区始扩大到全岛。1945年抗日战争胜利，鼓浪屿公共租界由国民政府收回，设置鼓浪屿区。厦门市辖厦西、厦南、厦港、禾山和鼓浪屿5个区。翌年并厦西、厦南为中心区。1948年3月，析中心区置开元区，同年10月，中心区改名思明区。至此，厦门市辖开元、思明、厦港、鼓浪屿、禾山5个区，下设57个保。